کپستون بیوانفورماتیک گیاهی

15 سال گذشته در زیست شناسی گیاهی سال های هیجان انگیزی بوده است. صدها ژنوم گیاهی توالی یابی شده اند، RNA-seq پروفایل بیان گسترده ترانسکریپتوم را فعال کرده است، و تکثیر روش های مبتنی بر "-seq" اجازه داده است تا تعاملات پروتئین-پروتئین و پروتئین-DNA ارزان و با کارایی بالا تعیین شود. روش این مجموعه داده‌ها به نوبه خود به ما اجازه می‌دهند تا فرضیه‌هایی را با کلیک ماوس یا ضربه زدن انگشت ایجاد کنیم. در Plant Bioinformatics در Coursera.org، ما 33 ابزار آنلاین خاص گیاهی را از مرورگرهای ژنوم گرفته تا داده‌کاوی رونویسی گرفته تا تجزیه و تحلیل‌های مروج/شبکه ​​و موارد دیگر پوشش دادیم، و در این Capstone Bioinformatics گیاهی از این ابزارها برای فرضیه نقش بیولوژیکی برای یک ژن با عملکرد ناشناخته، در یک گزارش آزمایشگاهی مکتوب خلاصه شده است. این دوره بخشی از تخصص بیوانفورماتیک گیاهی در Coursera است که صلاحیت ها و منابع اصلی بیوانفورماتیک مانند Genbank NCBI، Blast، ترازهای توالی چندگانه، فیلوژنتیک در روش های بیوانفورماتیک I، و به دنبال آن برهمکنش های پروتئین-پروتئین، ساختاری و بیوانفورماتیک را معرفی می کند. تجزیه و تحلیل در روش های بیوانفورماتیک II، علاوه بر مفاهیم و ابزارهای خاص گیاهی که در Plant Bioinformatics و Plant Bioinformatics Capstone معرفی شده اند. این دوره/سرمایه با سرمایه گذاری صندوق ابتکار دوره آزاد دانشکده هنر و علم دانشگاه تورنتو (OCIF) توسعه یافته و توسط Eddi Esteban، Will Heikoop و Nicholas Provart اجرا شده است. آشر پاشا یک تصادفی ساز شناسه ژنی را برنامه ریزی کرد.