RNA-Seq with Bioconductor in R

RNA-Seq یک روش مهیج توالی‌یابی نسل بعدی است که برای شناسایی ژن‌ها و مسیرهای زمینه‌ای بیماری‌ها یا شرایط خاص استفاده می‌شود. با مقرون به صرفه‌تر شدن و در دسترس‌تر شدن توالی‌یابی با توان بالا برای جامعه وسیع‌تری از محققان، دانش تجزیه و تحلیل این داده‌ها به یک مهارت با ارزش فزاینده تبدیل می‌شود. برای آشنایی با گردش کار RNA-Seq و کشف چگونگی شناسایی ژن ها و فرآیندهای بیولوژیکی که ممکن است برای شرایط مورد علاقه شما مهم باشند، به ما بپیوندید! ما دوره را با مروری مختصر از گردش کار RNA-Seq با تأکید بر تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل (DE) آغاز خواهیم کرد. با شروع شمارش برای هر ژن، این دوره نحوه آماده سازی داده ها برای تجزیه و تحلیل DE، ارزیابی کیفیت داده های شمارش، و شناسایی نقاط پرت و شناسایی منابع اصلی تنوع در داده ها را پوشش می دهد. بسته DESeq2 R برای مدل‌سازی داده‌های شمارش با استفاده از یک مدل دوجمله‌ای منفی و آزمایش ژن‌های بیان‌شده متفاوت استفاده خواهد شد. تجسم نتایج با نقشه‌های حرارتی و نمودارهای آتشفشانی انجام خواهد شد و ژن‌های متفاوت بیان شده شناسایی و ذخیره خواهند شد.