بیوانفورماتیک باکتریایی

این دوره نمایش ها و تمرین هایی را برای انجام وظایف تجزیه و تحلیل مبتنی بر ژنومیک رایج داده های توالی باکتریایی ارائه می دهد. از BV-BRC، مرکز منابع بیوانفورماتیک باکتریایی و ویروسی (ادغام PATRIC، IRD و ViPR، سه منبع قبلی)، به عنوان بستری برای تجزیه و تحلیل استفاده می‌کند. BV-BRC مرکز منابع بیوانفورماتیک باکتریایی با بودجه NIH/NIAID است که داده های ژنومی باکتریایی جامع را با ابزارهای تجزیه و تحلیل یکپارچه و تجسم ارائه می دهد. BV-BRC همچنین یک فضای کاری خصوصی را فراهم می کند که کاربران می توانند داده های خود را بارگذاری و تجزیه و تحلیل کنند. شرکت‌کنندگان دوره مهارت‌های لازم برای انجام تجزیه و تحلیل مقایسه‌ای ژنوم‌های باکتریایی را به دست می‌آورند، که با داده‌های توالی خام شروع می‌شود. درس‌های ماژول اول، مونتاژ ژنوم، حاشیه‌نویسی، ساخت درخت فیلوژنتیک، و مقایسه‌های خانواده پروتئین/پروتئوم را شامل می‌شود. هر درس بر پایه درس قبلی استوار است و یک گردش کار تجزیه و تحلیل پایه کامل ایجاد می کند. توجه: تمرین‌های این دوره با استفاده از PATRIC، سیستم پیشین BV-BRC توسعه داده شده‌اند. با این حال، BV-BRC از PATRIC ساخته شده است، بنابراین بیشتر محتوا هنوز یکسان است.