علم و خوشه‌بندی داده‌های ژنومی (بیوانفورماتیک V)

چگونه استنباط کنیم که کدام ژن فرآیندهای مختلف را در سلول هماهنگ می کند؟ چگونه انسان ها از آفریقا مهاجرت کردند و در سراسر جهان پخش شدند؟ در این کلاس، خواهیم دید که این دو سوال به ظاهر متفاوت را می توان با استفاده از تکنیک های الگوریتمی و یادگیری ماشینی مشابه که از مشکل کلی تقسیم نقاط داده به خوشه های مجزا ناشی می شود، پرداخت. در نیمه اول دوره، الگوریتم هایی را برای خوشه بندی گروهی از اشیاء در مجموعه ای از خوشه ها بر اساس شباهت آنها، که یک مسئله کلاسیک در علم داده است، معرفی خواهیم کرد و خواهیم دید که چگونه می توان این الگوریتم ها را برای داده های بیان ژن اعمال کرد. در نیمه دوم دوره، ابزار کلاسیک دیگری در علم داده به نام تجزیه و تحلیل مؤلفه های اصلی را معرفی خواهیم کرد که می تواند برای پیش پردازش داده های چند بعدی قبل از خوشه بندی در تلاش برای کاهش تا حد زیادی ابعاد عددی بدون از دست دادن بسیاری از "سیگنال" استفاده شود. داده ها در نهایت، یاد خواهید گرفت که چگونه از ابزارهای محبوب نرم افزار بیوانفورماتیک برای حل یک مشکل واقعی در خوشه بندی استفاده کنید.