تکامل مولکولی (بیوانفورماتیک IV)

در دوره قبلی در Specialization، نحوه مقایسه ژن ها، پروتئین ها و ژنوم ها را یاد گرفتیم. یکی از راه‌هایی که می‌توانیم از این روش‌ها استفاده کنیم، ساختن «درخت زندگی» است که نشان می‌دهد چگونه مجموعه بزرگی از موجودات مرتبط در طول زمان تکامل یافته‌اند. در نیمه اول دوره، رویکردهایی را برای ساخت و ساز درخت تکاملی که موضوع برخی از پراستنادترین مقالات علمی در تمام دوران بوده است، مورد بحث و بررسی قرار خواهیم داد و نشان خواهیم داد که چگونه می توانند مشکلات را از یافتن منشاء یک ویروس کشنده تا مکان یابی حل کنند. زادگاه انسان های مدرن در نیمه دوم دوره، دنده‌ها را عوض می‌کنیم و ادعای قدیمی مبنی بر تکامل پرندگان از دایناسورها را بررسی می‌کنیم. چگونه می توانیم این را ثابت کنیم؟ به طور خاص، ما نتیجه ای را بررسی خواهیم کرد که ادعا می کند پپتیدهای برداشت شده از فسیل T. rex با پپتیدهای موجود در جوجه ها مطابقت نزدیکی دارند. به طور خاص، ما از روش‌هایی از پروتئومیکس محاسباتی استفاده خواهیم کرد تا بپرسیم چگونه می‌توانیم این نتیجه را معتبر یا ناشی از نوعی آلودگی ارزیابی کنیم. در نهایت، یاد خواهید گرفت که چگونه از ابزارهای نرم افزاری بیوانفورماتیک محبوب برای بازسازی درخت تکاملی ویروس ابولا و شناسایی منبع اپیدمی اخیر ابولا که باعث سرفصل های جهانی شده است، استفاده کنید.